OBLASŤ AKREDITÁCIE

Prepis

1 1 z 13 Fixný rozsah akreditácie Názov akreditovaného subjektu: Onkologický ústav sv. Alžbety, s.r.o Heydukova 10, Bratislava Ústav laboratórnej medicíny SZU a OÚSA Oddelenie klinickej biochémie Oddelenie imunodiagnostiky Oddelenie hematológie a transfuziológie Oddelenie klinickej imunológie a alergológie Ústav patológie SZU a OÚSA Oddelenie klinickej patológie a cytológie Oddelenie klinickej biochémie OKB Ústav laboratórnej medicíny SZU a OÚSA Glukóza (GLU) Močovina (UREA) Kreatinín (KREA) Kyselina močová (KM) Bielkoviny celkové (CB) Albumín (ALB) Bilirubín celkový (BILT) 8 Aspartát-aminotransferáza (AST) 9 Alanin-amino-transferáza (ALT) 10 Gama-glutamyltransferáza (GMT) 11 Alkalická fosfatáza (ALP) Cholesterol (CHOL) Triacylglyceridy (TAG) Sodík (NA) Draslík (K) Chloridy (CL) Vápnik (CA) Nepriama potenciometria Nepriama potenciometria Nepriama potenciometria Beckman Coulter Glukose (SPP OKB/ 1) Beckman Coulter Urea (ŠPP OKB/ 2) Beckman Coulter Creatinine Enz. (ŠPP OKB/ 3) Beckman Coulter Uric Acid (ŠPP OKB/ 4) Beckman Coulter Total Protein (ŠPP OKB/ 5) Beckman Coulter Albunin (ŠPP OKB/ 6) Biolatest BIL T DCA L500 (ŠPP OKB/ 7) Beckman Coulter AST (ŠPP OKB/ 8) Beckman Coulter ALT (ŠPP OKB/ 9) Beckman Coulter GGT (ŠPP OKB/ 10) Beckman Coulter ALP (ŠPP OKB/ 11) Beckman Coulter Cholesterol (ŠPP OKB/ 12) Beckman Coulter Triglyceride (ŠPP OKB/ 13) Beckman Coulter ISE Reagents (ŠPP OKB/ 14) Beckman Coulter ISE Reagents (ŠPP OKB/ 15) Beckman Coulter ISE Reagents (ŠPP OKB/ 16) Beckman Coulter Calcium Arsenazo (ŠPP OKB/ 17) Hexokinázová metóda (HK) Enzýmová metóda Ureáza/ GLDH Enzymatická metóda Enzýmová metóda Urikáza/POD s Askorbátoxidázou Biuretová metóda Brómkrezolová zeleň (BCG) Metóda s DCA IFCC (TRIS, 37 C), modifikovaná metóda bez PLP IFCC (TRIS, 37 C), modifikovaná metóda bez PLP IFCC (37 C) metóda IFCC metóda (AMP pufer, 37 C) Enzýmová metóda CHOD/POD/ 4-aminoantipyrin Enzýmová metóda GPO/ POD ISE metóda ISE metóda ISE metóda Metóda s Arsenazo

2 2 z Fosfor (P) Horčík (MG) Železo (FE) 21 Laktátdehydrogenáza (LDH) 22 Kreatínkináza (CK) krv Amyláza (AMS) Imunoglobulín G (IGG) Imunoglobulín A (IGA) Imunoglobulín M (IGM) C-reaktívny proteín (CRP) Komplement C3 (C3) Komplement C4 (C4) Folát (FOL) Vitamín B12 (VITB12) Cortizol (CORT) Glykovaný hemoglobín (HBA1c) Imunoturbidimetria Imunoturbidimetria Imunoturbidimetria Imunoturbidimetria Imunoturbidimetria Imunoturbidimetria HPLC Beckman Coulter Inorg. Phosphor. (ŠPP OKB/ 18) Beckman Coulter Magnesium (SPP OKB/ 19) Beckman Coulter Iron (ŠPP OKB/ 20) Beckman Coulter LD (ŠPP OKB/ 21) Beckman Coulter CK (NAC) (ŠPP OKB/ 22) Beckman Coulter α-amylase (ŠPP OKB/ 23) Beckman Coulter IgG (ŠPP OKB/ 24) Beckman Coulter IgA (ŠPP OKB/ 25) Beckman Coulter IgM (ŠPP OKB/ 26) Beckman Coulter CRP Latex (ŠPP OKB/ 27) Beckman Coulter C3 (ŠPP OKB/ 30) Beckman Coulter C4 (ŠPP OKB/ 31) Beckman Coulter FOLATE (ŠPP OKB/ 32) Beckman Coulter VITAMIN B12 (ŠPP OKB/ 33) Beckman Coulter CORTISOL (ŠPP OKB/ 34) Bio-Rad Instruction Manual (ŠPP OKB/ 35) UV-molybdátová metóda Xylidylová modrá Metóda s TPTZ IFCC metóda (37 C, L P) IFCC metóda (NAC, 37 C) IFCC metóda ( ethyliden- G7PNP) Latex Oddelenie imunodiagnostiky OID 1 2 Protilátky proti tyreoidálnej peroxidáze (ATPO) Karcinoembryonálny antigén (CEA) Ústav laboratórnej medicíny SZU a OÚSA anti-tpo ARCHITEKT apl.list (ŠPP OID/1) Beckman Coulter apl. list Access CEA (ŠPP OID/2) Dvojkroková.imunoanal. chemilum. reakcia na mikročasticiach s polyklonálnou protilátkou Sendičová imunoenzymatická pomocou monoklonálnych protilátok 3 Nádorový antigén 125 (CA 125) ARCHITEKT apl. list CA 125 II Architect (ŠPP OID/3) Chemiluminscenčná na mikročasticiach pomocou monoklonálnych protilátok 4 Uhľohydrát. antigén 15-3 (CA 15-3) ARCHITEKT apl. list CA 15-3 Architect (ŠPP OID/4) Chemiluminscenčná na mikročasticiach pomocou monoklonálnych protilátok

3 3 z Uhľohydrát. antigén 19-9 (CA 19-9) Voľný tyroxín (FT4) Voľný trijódtyronín (FT3) Tyreotropín (TSH) Tyreoglobulín (TG) Alfafetoproreín (AFP) Choriogonadotropín (HCG) Cytokeratínový fragment 19 (CYFRA 21-1) Prostatatický špecifický antigén celkový (PSA) Prostatatický špecifický antigén voľný (fpsa) Neurónšpecifická enoláza (NSE) Karcino-antigén skvamóznych buniek (SCC) TRACE Chemiluminis - cenčná TRACE Beckman Coulter apl. list Acces GI Monitor (ŠPP OID/5) Beckman Coulter apl. list Access freet4 (ŠPP OID/6) Beckman Coulter apl. list Access freet3 (ŠPP OID/7) Beckman Coulter HYPERsensitive htsh (ŠPP OID/8) BRAHMS apl.list TG Kryptor, (ŠPP OID/9) Beckman Coulter apl. list Access AFP (ŠPP OID/10) Beckman Coulter apl. list Access total BHCG (5th IS) (ŠPP OID/11) ARCHITEKT apl. list CYFRA 21-1 (ŠPP OID/12) Beckman Coulter apl. list Acces Hybritech PSA (ŠPP OID/13) Beckman Coulter apl. list Acces Hybritech freepsa (ŠPP OID/14) BRAHMS apl.list NSE Kryptor, (ŠPP OID/15) ARCHITEKT apl.list SCC (ŠPP OID/16) Sendvičové imunoenzymatické stanovenie pomocou polyklonálnych protilátok Dvojkroková.imunoanal. chemilum. reakcia na mikročasticiach s polyklonálnou protilátkou Dvojkroková.imunoanal. chemilum. reakcia na mikročasticiach s polyklonálnou protilátkou Dvojkroková imnoanal. chemilum. reakcia na mikročasticiach s dvoma monoklonálnymi protilátkami Homogénna sendvičová munofluoro TRACE s dvomi značenými monoklonálnymi protilátkami Sendvičové imunoenzymatické chemiluminiscenčné stanovenie pomocou monoklonálnych protilátok Sendvičové imunoenzymatické chemiluminiscenčné stanovenie pomocou monoklonálnych protilátok Dvojkroková chemiluminiscenčná Sendvičové imunoenzymatické chemiluminiscenčné stanovenie pomocou monoklonálnych protilátok Sendvičové imunoenzymatické chemiluminiscenčné stanovenie pomocou monoklonálnych protilátok Homogénna sendvičová imunofluoro TRACE s dvomi značenými monoklonálnymi protilátkami Dvojkroková imunoanal. chemilum. reakcia na mikročasticiach s dvoma monoklon. protilátkami

4 4 z 13 Oddelenie hematológie a transfuziológie OHT Systém/ 1 celá krv 2 celá krv celá krv v citráte Na v citráte Na v citráte Na Krvný obraz bez diferenciál. rozpočtu leukocytov + Diferenciálny rozpočet leukocytov z KO Krvný obraz bez diferenciál. rozpočtu leukocytov Retikulocyty a ich parametre Aktivovaný parciálny tromboplastíno vý čas Protrombínový čas Trombínový čas WBC RBC HGB HCT MCV MCH MCHC PLT RDW CV MPV PDW Lymfocyty Ab. počet LYMPH Monocyty Ab. počet MONO Granulocyt NEU Ab. počet GrNEU Granulocyty EO Ab. počet GrEO Granulocyty BA Ab. počet GrBA WBC RBC HGB HCT MCV MCH MCHC PLT RDW CV MPV Retikulocyty Retik.-ab. poč APTT APTT R. QUICK% QUICK INR TT TT Ratio Ústav laboratórnej medicíny SZU a OÚSA Princíp/ Druh/ Elektrická impedancia Prietoková cytometria Elektrická impedancia Elektrická impedancia Prietoková cytometria KOAG KOAG KOAG Beckman Coulter DxH800/ (ŠPP 11HTO) Beckman Coulter DxH800/ (ŠPP 10HTO) Beckman Coulter DxH800/ (ŠPP 15HTO) ACL TOP500 /Sysmex CD1500 Aplikačný list pre Synthasil (ŠPP 2HTO) ACL TOP500 /Sysmex CD1500 Aplikačný list pre RecombiPlastin 2G (ŠPP 1HTO) ACL TOP500 /Sysmex CD1500 Aplikačný list pre Thrombin (ŠPP 3HTO) 7 v citráte Na Fibrinogén KOAG ACL TOP500 /Sysmex CD1500 Aplikačný list pre QFA Thrombin (ŠPP 4HTO)

5 5 z 13 Systém/ Princíp/ Druh/ celá krv a erytrocyty z transfúzneh o prípravku celá krv Krvná skupina KS+Rh(D) AGLUT Skríning anti- Ery protilátok Stanovenie CD znakov Krížny pokus Skríning NAT NAT-P1 NAT-P2 NAT-P3 CD3 CD2 CD4 CD5 CD8 CD56 CD7 CD45 CD3/CD8 CD3/CD4 CD10 CD19 CD20 CD23 Kappa Lambda Kappa/CD19 Lambda/CD19 CD38 CD22 CD11c CD33 CD13 CD34 CD14 HLA DR CD16 CD15 AGLUT AGLUT AGLUT AGLUT AGLUT Prietoková cytometria Galileo ECHO Manuál/Aplikačné listy (ŠPP 22HTO) Galileo ECHO Manuál/Aplikačné listy (ŠPP 23HTO) Galileo ECHO Manuál/Aplikačné listy (ŠPP 24HTO) Becton Dickinson FACS Canto - Manuál (ŠPP 30HTO) IMF Oddelenie klinickej imunológie a alergológie OKIA 1 krv 2 krv 3 Stanovenie CD znakov Stanovenie fagocytovej aktivity Stanovenie celkového IgE / Parameter CD3 (T Lymfocyty) CD4 (Pomocné T Lymfocyty) CD8 (Cytotoxické T Lymfocyty) CD19 (B Lymfocyty) CD3-/CD16+56 (NK bunky) FAGO Vyšetrenie fagocytárnej aktivity granulocytov IGE - Stanovenie celkového IgE Laboratórium s fixným rozsahom Prietoková cytometria Prietoková cytometria FEIA (Fluorescenčná enzýmová ) Becton Dickinson FACS Canto (ŠPP OKIA/ ) FagoFlowEx Kit, Exbio (ŠPP OKIA/2.1) ImmunoCAP Total IgE (ŠPP OKIA3.2/)

6 6 z 13 / Parameter Stanovenie špecifických IgE SIGE - Stanovenie špecifických IgE SIGE - Stanovenie špecifických IgE Stanovenie parametrov humorálnej odpovede potravinové intolerancie autoprotilátky Stanovenie zložiek komplementu GLIAA Stanovenie protilátok triedy IgA proti gliadínu GLIAG Stanovenie protilátok triedy IgG proti gliadínu TTG A Stanovenie protilátok triedy IgA proti tkanivovej transglutamináze ASCA Stanovenie protilátok triedy IgA proti Saccharomyces cerevisiae ASCAG Stanovenie protilátok triedy IgG proti Saccharomyces cerevisiae RFC Stanovenie protilátok triedy IgA, IgM, IgM proti reumatoidnému faktoru CCP Stanovenie protilátok proti cyklickému citrulínovému proteínu C1F Vyšetrenie funkčnej aktivity C1 inhibítora Enzýmová FEIA (Fluorescenčná enzýmová ) Enzýmová Enzýmová HY-TEC Specific IgE HYCOR (ŠPP OKIA/4.1) ImmunoCAP Specific IgE Phadia (ŠPP OKIA/4. 2 ) DSX Anti-Gliadin (GAF-3X) ELISA-(IgA) Euroimmun (ŠPP OKIA/5.1.3) Anti-Gliadin (GAF-3X) ELISA-(IgG) Euroimmun (ŠPP OKIA/5.1.4) Protilátky proti tkaňové transglutamnáze ELISA (IgA) Euroimmun (ŠPP OKIA/5.1.5) EIA Anti-ASCA IgA AIDA (ŠPP anti-asca IgA 5.1.6) EIA Anti-ASCA IgG AIDA (ŠPP anti-asca IgG 5.1.7) Rf-Check, AIDA (ŠPP OKIA/5.2.2) RA/CP Detect, AIDA (ŠPP OKIA/5.2.3) A003-MicroVue C1- Inhibitor Plus EIA Kit, Quidel (ŠPP OKIA/6.1) Oddelenie klinickej patológie a cytológie -OKPC 1 tkanivo 2 moč, výpotok, otlačok, ascitická tekutina, náter PAB (punkčná aspiračná biopsia) histopatologické zmeny cytopatologické zmeny Ústav patológie SZU a OÚSA Oddelenie klinickej patológie a cytológie -OKPC ŠPP OKPC/01 ŠPP OKPC/02 histológia peroperačné biopsie spracovanie Histologické ŠPP OKPC/03 tvrdých tkanív histochémia *1 vyšetrenie tkaniva ŠPP OKPC/04 imunohistochémia *2 mikroskopické hodnotenie (biopsia) (Literatúra viď. príloha č. 4) cytologické vyšetrenie negynekolo-gické ŠPP OKPC/05 (Literatúra viď. príloha č. 4) farbenie náterov polychromatickou metódou podľa Papanicolaua*1,3 mikroskopická diagnostika

7 7 z 13 3 gynekologický ster, odobratý na Liquid based cytology (LBC) cytopatologické zmeny cytologické vyšetrenie gynekologické, Liquid based cytology (LBC) *1 Príloha 1. Zoznam histochemických farbiacich a impregnačných metód na OKPC ÚP 1. Farbenie hematoxylínom-eozínom 2. Dôkaz polysacharidov PAS reakciou podľa Mc Manusa 3. Farbenie HP podľa Giemsu 4. Impregnácia podľa Gomoriho 5. Farbenie kolagénvých vlákien podľa van Giesona 6. Dôkaz železa Perlsovou reakciou 7. Amyloid kongočerveňou podľa Puchtlerovej 8. Impregnačná metóda podľa Grimeliusa 9. Mallory - farbenie na fibrín 10. Kyslé mukopolysacharidy - Alciánová modrá 11. Farbenie na dôkaz Melanínu podľa Lignaca 12. Mucikarmín podľa Mayera 13. Dôkaz Mycbacterium tuberculosis podľa Ziehl-Neelsena 14. Baktérie podľa Gramma 15. Dôkaz glykogénu metódou PAS-diastáza 16. Zelený Trichróm podľa Massona 17. Dôkaz lipidov podľa Lillieho 18. Rezorcín-fuchsín podľa Weigerta na elastické vlákna 19. Dôkaz plesní impregnačná metóda podľa Gomoriho 20. Kombinovaná metóda PAS Alciánová modrá ŠPP OKPC/06 (Literatúra viď. príloha č. 4) *2 Príloha 2. Zoznam všetkých antigénov vyšetrovaných imunohistochemickou metódou na OKPC ÚP Protilátka proti antigénu Skratka Výrobca Aktín (smooth muscle) ASM Dako Alfa-1-fetoproteín AFP Dako Androgénový receptor AR Novocastra Bcl-2 BCL2 Dako Βetacatenin BCAT Dako Caldesmon CDES Dako Calretinin CRT Dako CD10 CD10 Novocastra CD20cy CD20, L26 Dako CD30 CD30 Dako CD31 CD31 Dako CD34 Class II CD34 Dako CD45 CD45, LCA Dako CD45RO CD45RO, UCHL1 Dako CD56 CD56 Dako CD68 CD68 Novocastra CD99 CD99 Dako CD117 CD117 Dako CDX2 CDX2 Dako Cytokeratín 5/6 CK5/6 Dako Cytokeratín 7 CK7 Novocastra Cytokeratín 18 CK18 Dako Cytokeratín 19 CK19 Dako Cytokeratín 20 CK20 Novocastra Cytokeratín AE1/AE3 AE1/3 Dako Cytokeratín HMW CKHMW Dako Dezmín DEZ Novocastra EGFR EGFR Dako E-kadherín CAD Dako Epitelový membránový antigén EMA Dako Estrogénový receptor ER Novocastra Gastrin GAST Dako Glukagon GLUK Dako Gross cystic disease fluid protein-15 GCDF Dako Ľudský choriogonadotropín HCG Dako Helicobacter pylori HP Dako Hepatocyte HEP Dako HER2 HER2 Dako Chromogranín A CHROM Dako farbenie náterov polychromatickou metódou podľa Papanicolaua*3, imunocytochémia mikroskopická diagnostika, systém diagnostického hodnotenia gynekologickej cytológie Bethesda 2001

8 8 z 13 Inhibín INH Novocastra Inzulín INZ Dako Kalcitonín KALC Dako Kappa light chains IgK Dako Karbonická anhydráza IX CAIX BioScience Karcinoembryonálny antigén (monoklonálna) CEA Dako Ki-67 Ki-67 Novocastra Lambda light chains IgL Dako Mammaglobin MAM Dako Melan A MELAN Dako Melanozóm HMB45 Dako Mismatch repair protein MLH1 MLH1 Novocastra Mismatch repair protein MSH2 MSH2 Novocastra Mismatch repair protein MSH6 MSH6 Dako Mismatch repair protein PMS2 PMS2 Dako Myogenin MG Dako Enoláza špecifická pre neuróny NSE Dako OCT3/4 OCT3/4 Novocastra Placentárna alkalická fosfatáza PLAP Novocastra p16 p16 Santa Cruz Biotechnology p53 p53 Novocastra p63 p63 Dako -metyl-coa Racemáza AMACR Dako Progesterónový receptor PR Novocastra Prostatický špecifický antigén PSA Dako Serotonin SRT Dako Somatostatin SOM Dako S-100 S-100 Dako Synaptofyzín SYN Novocastra Tyreoglobulín THG Dako Tyreoidný transkripčný faktor -1 TTF-1 Dako Vimentín VIM Dako WT1 WT1 Dako *3 Príloha 3. Zoznam cytochemických farbení používaných na ÚP 1. Farbenie hematoxylínom-eozínom 2. Farbenie podľa Giemsa Romanowski 3. Farbenie podľa Papanicolaoua polychróm EA-50 (PAP) 4. Imunocytochemické vyšetrenie antigénu p16 a Ki67 *4 Príloha 4. Zoznam použitej literatúry : Literatúra použitá v ŠPP OKPC/01 1. Rosai and Ackerman: Surgical Pathology, ed. Juan Rosai, 9. vyd., Mosby Elsevier inc Lever s Histopathology of the Skin, ed. David E. Elder, 9. vyd., Lippincott Williams&Wilkins Vacek Z.: Histologie a histologická technika, 1. vyd., Institut pro další vzdělávání pracovníků ve zdravotnictví Mezinárodní klasifikace nemocí pro onkologii, 3. vyd., Světová zdravotnická organizace Pathology and Genetics of Tumours of Haematopoietic and Lymphoid Tissues, ed. Elaine S. Jaffe, Nancy Lee Harris, Harald Stein, James W. Vardiman, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Breast and Female Genital Organs, ed. Fattaneh A. Tavassoli, Peter Devilee, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Digestive System, ed. Stanley R. Hamilton, Lauri A. Aaltonen, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of Soft Tissue and Bone, ed. Christopher D. M. Fletcher, K. Krishnan Unni, Fredrik Mertens, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Urinary System and Male Genital Organs, ed. John N. Eble, Guido Sauter, Jonathan I. Epstein, Isabell A. Sesterhenn, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Nervous System, ed. Paul Kleihnes, Webster K. Cavenee, IARCPress Blaustein s Pathology of the Female Genital Tract, ed. Robert J. Kurman, Springer-Verlag New York Rosen P. P.: Rosen s Breast Pathology, Lippincott Williams&Wilkins Literatúra použitá v ŠPP OKPC/02 1. Čunderlíková, M., Balážová, V.: Vybrané kapitoly z histologickej techniky. Vydavateľstvo Osveta, 1990, s:167, ISBN Vacek Z.: Histologie a histologická technika, 1. vyd., Institut pro další vzdělávání pracovníků ve zdravotnictví Susan C. Lester: Manual of Surgical Pathology, 2 edition, Elsevier Churchill Livingstone Bancroft J.D., Gamble M.: Theory and practice of histological techniques. Churchil-Livingstone, 6th. edition, ISBN , s Callis G.M: Bone. In: Bancroft J.D., Gamble M.: Theory and practice of histological techniques. Churchil-Livingstone, 6th. edition, s: Literatúra použitá v ŠPP OKPC/03 1. Susan C. Lester: Manual of Surgical Pathology, 2 edition, Elsevier Churchill Livingstone Rosai and Ackerman: Surgical Pathology, ed. Juan Rosai., 9. vyd., Mosby Elsevier inc Lever s Histopathology of the Skin, ed. David E. Elder, 9. vyd., Lippincott Williams&Wilkins Vacek Z.: Histologie a histologická technika, 1. vyd., Institut pro další vzdělávání pracovníků ve zdravotnictví Mezinárodní klasifikace nemocí pro onkologii, 3. vyd., Světová zdravotnická organizace Pathology and Genetics of Tumours of Haematopoietic and Lymphoid Tissues, ed. Elaine S. Jaffe, Nancy Lee Harris, Harald Stein, James W. Vardiman, IARCPress 2001.

9 9 z Pathology and Genetics of Tumours of the Breast and Female Genital Organs, ed. Fattaneh A.Tavassoli, Peter Devilee, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Digestive System, ed. Stanley R. Hamilton, Lauri A. Aaltonen, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of Soft Tissue and Bone, ed. Christopher D. M. 10. Fletcher, K. Krishnan Unni, Fredrik Mertens, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Urinary System and Male Genital Organs, ed. John N. Eble, Guido Sauter, Jonathan I. Epstein, Isabell A. Sesterhenn, IARCPress Pathology and Genetics of Tumours of the Nervous System, ed. Paul Kleihnes, Webster K. Cavenee, IARCPress Blaustein s Pathology of the Female Genital Tract, ed. Robert J. Kurman, Springer-Verlag New York Rosen P. P.: Rosen s Breast Pathology, Lippincott Williams&Wilkins 2001 Literatúra použitá v ŠPP OKPC/04 1. Gomolčák, P: Základy imunohistochémie v patológii. IDVPZ, Brno, 1997, 92 s. ISBN Key, M. et al.: Immunohistochemical staining methods, fourth edition, education guide. DAKO corporatio, Carpintéria, California, 2006, 174 s. 3. Lukáš Z, Dráberová E, Feit J, Vojtěšek B: Imunohistochemické metody v biologii a v bioptické diagnostice. Acta facultatis medicae Universitatis Masarykianae Brunensis, Sborník prací LF v Brně č. 112, LF Masarykovy University, Brno, 1997, 147 s. ISBN X. 4. Taylor CR, Cote RJ: Immunomicroscopy a diagnostic tool for the surgical pathologist, third edition. Saunders Elsevier, 2006, 531 s. ISBN Shi S-R, Key ME, Kalra KL. Antigen retrieval in formalinfixed, paraffin-embedded tissues: an enhancement method for immunohistochemical staining based on microwave oven heating of tissue sections. J Histochem Cytochem 1991, 39(6): Shi S-R, Cote RJ, Taylor CR. Antigen retrieval immunohistochemistry: past, present, and future. J Histochem Cytochem 1997, 45 (3): Miller RT. Technical immunohistochemistry: achieving reliability and reproducibility of immunostains. [online]. New York: Society for Applied Immunohistochemistry, Annual Meeting, 2001 [cit ] Dostupné na: < Literatúra použitá v ŠPP OKPC/05 1. Wied.G.,Keebler C.M, Koos L.G., Patten S.F.,Rosenthal D.L., Compendium on Diagnostic Cytology 2. Richard M De May: The Art and Science of Cytopathology 3. Adam P., Taborský L., Sobek O., Kolbich P.,:Cytogy of cerebrospinal fluid 4. Takahashi M.:Color atlas of cancer cytology Literatúra použitá v ŠPP OKPC/06 1. Wied.G.,Keebler C.M, Koos L.G., Patten S.F.,Rosenthal D.L., Compendium on Diagnostic Cytology 2. Richard M De May: The Art and Science of Cytopathology 3. J.Kobilková, J.Siracký a kol.:cytodiagnostika v gynekologii 4. J.Kobilková,Z.Lojda,J.Ondruš,A.Beková: Gynekologická cytodiagnostika 5. J.Kobilková: Základy cytopatológie

10 10 z 13 Flexibilný rozsah akreditácie Názov akreditovaného subjektu: Onkologický ústav sv. Alžbety, s.r.o Heydukova 10, Bratislava Ústav laboratórnej medicíny SZU a OÚSA Oddelenie lekárskej genetiky Flexibilný rozsah akreditácie je zverejnený na adrese: 1. Analýza germinatívnych variantov 1.1 Ľudská periférna krv -Germinatívne varianty v géne BRCA1/ Germinatívne varianty v géne RET Analýza somatických variantov Fixované/ natívne tkanivo Fixované/ natívne tkanivo/cytologi cké stery - Dôkaz germinatívnych variantov v géne MLH1 a MSH2 - Dôkaz germinatívnych variantov v géne VHL - Dôkaz germinatívnych variantov v paneli génov asociovaných s onkologickými hereditárnymi syndrómami - Dôkaz somatických variantov v exónoch 2, 3 a 4 génu KRAS a NRAS pri nádoroch kolorekta - Dôkaz somatických variantov v kodóne 600 génu BRAF pri nádoroch štítnej žľazy a malígnom melanóme - Dôkaz somatických variantov v exónoch 18, 19, 20 a 21 génu EGFR pri nemalobunkovom karcinóme pľúc Sekvenačná Sekvenačná Sekvenačná Sekvenačná Sekvenačná Mini-sekvenačná Real-Time Mini-sekvenačná Real-Time Mini-sekvenačná Real-Time ŠPP OLG/1 ŠPP OLG/2 ŠPP OLG/10 SPP OLG/14 (dolu uvedené orig. SPP OLG/15 (dolu uvedené orig. ŠPP OLG/5 ŠPP OLG/9 ŠPP OLG/5 ŠPP OLG/11 ŠPP OLG/5 Kvalitatívna skúška, Kvalitatívna skúška,

11 11 z Fixované/ natívne tkanivo -Dôkaz somatických variantov v géne BRCA1/2 4. Genotypizácia ľudských papilomavírusov Bunková suzpenzia, 4.1 fixované tkanivo, periférna krv -Genotypizácia HPV 5. Dôkaz prítomnosti HPV 5.1 Bunková suzpenzia -Dôkaz prítomnosti HPV Sekvenačná Mini-skevenačná Real-Time Real-Time ŠPP OLG/16 ŠPP OLG/3 ŠPP OLG/13 Kvalitatívna skúška, Kvalitatívna skúška, Kvalitatívna skúška, 6. Dôkaz veľkých génových prestavieb v génoch asociovaných s onkologickými hereditárnymi syndrómami metódou MLPA Ľudská - Dôkaz veľkých génových SPP OLG/17 periférna krv/ prestavieb v génoch asociovaných s 6.1. (dolu uvedené Kvalitatívna skúška, Fixované/ onkologickými hereditárnymi Fragmentačná orig. natívne tkanivo syndrómami metódou MLPA Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/1: 1. Friedman L., Ostermeyer E. A., Szabo C.I. a kol.: Confirmation of BRCA1 by analysis of germline mutations linked to breast and ovarian cancer in ten families. Nat. Genetics 8, , Miki Y., Katagiri T., Kasumi F. a kol.: Mutation analysis in the BRCA2 gene in primary breast cancer. Nat. Genetics 2, 245-7, Wagner T. M. U., Hirtenlehner K., Shen P. a kol.: Global sequence diversity of BRCA2: analysis of 71 breast cancer families and 95 control individuals of worldwilde populatins. Hum. Mol. Genetocs, Vol. 8, No. 3, QIAamp DNA Mini Kit and OIAamp DNA Blood Mini Kit Handbook 5. Nanodrop ND 1000 user s manual 6. Promega: Protocols and applications guide. The Source for Discovery.: cheapter Promega Corporation, USA, Amersham Pharmacia Biotech, DNA Silver Staining Kit, instructions. 8. BigDye Terminator v 1.1 Cycle Sequencing Kit, Protokol, Applied Biosystems 9. Applied Biosystems DNA Sequencing Analysis Software, Version 5,1 for Windows XP and 2000 Platforms, User Guide, Applied Biosystems 10. Applied Biosystems 3130/3130xl Genetic Analyzers, Getting Started Guide, Applied Biosystems 11. Konecny M et al.: Comprehensive genetic characterization of hereditary breast/ovarian cancer families from Slovakia. Breast Cancer Res Treat (2011) 126: Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/2: 1. Ceccherini I., Hofstra R.M.W., Luo Y. a kol.: DNA polymorphisms and conditions for SSCP analysis of the 20 exons of the RET proto-oncogene, Oncogene 9, , De Groot et al.: RET as a dignostic and therapeutic target in sporadic and hereditary endocrine tumors Endocrine Reviews 27(5): Martucciello G, Lerone M, et al.: Multiple endocrine neoplasias type 2B and RET proto-oncogene. Ital J Pediatr Mar 19;38:9. doi: / Review. Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/3: 1. Weismanová E., Weismann P., Vizváryová M. a kol.: New approach to human high-risk papillomavirus (HR-HPV) genotyping. Neoplasma 49, , Amersham Biosciences, GenomicPrep Cells and Tissue DNA Isolation Kit, instructions. 3. Amersham Pharmacia Biotech, QuickPrep Total RNA Extraction Kit, instructions. 4. Amersham Pharmacia Biotech, Ready To Go You-Prime First-Strand Beads, instructions. 5. Amersham Pharmacia Biotech, Ready To Go Beads, instructions. 6. Amersham Pharmacia Biotech, DNA Silver Staining Kit, instructions. 7. F-HPV typing TM Kit, Manual. Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/5: 1. Van Krieken J. H. J. M., Jung A., Kirchner T. a kol.: KRAS mutation testing for predicting response to anti-egfr therapy for colorectal carcinoma: proposal for an European quality assurance program. Virchows Arch (2008) 453: Lievre A., Bachet J., Le Corre D., a kol.: KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer. Cancer Res (2006) 66:8. 3. TheraScreen K-RAS Mutation, Manual. 4. BigDye Terminator v 1.1 Cycle Sequencing Kit, Protokol, Applied Biosystems 5. Applied Biosystems DNA Sequencing Analysis Software, Version 5,1 for Windows XP and 2000 Platforms, User Guide, Applied Biosystems 6. Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzers, Getting Started Guide, Applied Biosystems 8. SNaPshot Multiplex Kit protocol and manual.

12 12 z 13 Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/9: 1. Nikiforov YE: thyroid carcinoma: molecular pathways and therapeutic targets. Modern pathology 21:S37-S Elisei R, Ugolini C, Viola D, Lupi C et al: BRAF V600E mutation and outcome of patients with papillary thyroid carcinoma: A 15-year median follow-up study. J Clin endocrine Metab 93(10): SNaPshot Multiplex Kit protocol and manual. Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/10: 1. Brigitte Wolf, Silvia Henglmueller at al: Spectrum of germ-line MLH1 and MSH2 mutations in Austrian patientswith hereditary nonpolyposis colorectal cancer. The Middle European Journal of Medicine. 2005, 117/7 8: Elisabeth mangold, Constanze Pagenstecher et al.: Spectrum and frequencies of mutations in MSH2 and MLH1 identified in 1,721 german families suspected of hereditary nonpolyposis colorectal cancer. Int. J. Cancer 2005, 116, Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/11: 1. Rosell, R., Moran, T., Queralt, C., Porta, R., Cardenal, F., Camps, C., Majem, M., Lopez-Vivanco, G., Isla, D., Provencio, M., Insa, A., Massuti, B., Gonzalez-Larriba, J. L., Paz-Ares, L., Bover, I., Garcia-Campelo, R., Moreno, M. A., Catot, S., Rolfo, C., Reguart, N., Palmero, R., Sanchez, J.M., Bastus, R., Mayo, C., Bertran- Alamillo, J., Molina, M. A., Sanchez, J. J., Taron, M. (2009). Screening for epidermal growth factor receptor mutations in lung cancer. N Engl J Med. 361: Pérez-Soler, R., Chachoua, A., Hammond, L. A., Rowinsky, E. K., Huberman, M., Karp, M., Rigas, J., Clark, G. M., Santaba rbara, P., Bonomi, P. (2004). Determinants of Tumor Response and Survival With Erlotinib in Patients With Non Small-Cell Lung Cancer. Journal og Clinical Oncology. 22: Pines, G., Köstler, W. J.,Yosef Yarden Department of Biological Regulation, The Weizmann Institute of Science, Rehovot 76100, Israel. (2010). Oncogenic mutant forms of EGFR: lessons in signal transduction and targets for cancer therapy. FEBSLett. 584 (12): ABI PRISM SnaPshot Multiplex Kit Protocol and manual 5. cobas EGFR Mutation Test User Manual Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/13: 1. cobas 4800 HPV Test Dokument č SK, Roche Diagnostics GmbH 2.cobas 4800 HPV Test Dokument č , Roche Molecular Systems, Inc Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/14: 1. Nielsen SM, Rhodes L, Blanco I a kol., 2016: Von Hippel-Lindau Disease: Genetics and Role of Genetic Counseling in a Multiple Neoplasia Syndrome. J. Clin. Oncol. 34(18): Alberta Health Services, 2011: Renal cell carcinoma and genetic testing. Clinical Practice Guideline GU Chittiboina P, Lonser RR, 2015: Von Hippel-Lindau disease. Handb. Clin. Neurol.132: Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/15: 1. Hereditary Cancer Solution by Sophia Genetics User's guide using DNA library prep kit by Sophia genetics 48 samples 2. BRCA Hereditary Cancer MASTR Plus kit with drmid for Ilumina NGS systems instructions for use 3. Crawford, B., Adams, S. B., Sittler, et al. (2017). Multi-gene panel testing for hereditary cancer predisposition in unsolved high-risk breast and ovarian cancer patients. Breast cancer research and treatment, 163(2), Grissom, A. A., Friend, P. J. (2016). Multigene Panel Testing for Hereditary Cancer Risk. Journal of the advanced practitioner in oncology, 7(4), Lorans, M., Dow, E., Macrae, F.A., Winship, I.M., Buchanan, D.D. (2018) Update on Hereditary Colorectal Cancer: Improving the Clinical Utility of Multigene Panel Testing. Clin Colorectal Cancer, 17(2):e293-e305. Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/16: 1. Ledermann: PARP inhibitors in ovarian cancer. Annals of Oncology (2016) 27: i40 i44 2. Koczkowska M et al.: Detection of somatic BRCA1/2 mutations in ovarian cancer - next-generation sequencing analysis of 100 cases. Cancer Med Jul;5(7): Dougherty BA et al.: Biological and clinical evidence for somatic mutations in BRCA1 and BRCA2 as predictive markers for olaparib response in high-grade serous ovarian cancers in the maintenance setting. Oncotarget Jul 4;8(27): Maxwell KN et al.: BRCA locus-specific loss of heterozygosity in germline BRCA1 and BRCA2 carriers. Nat Commun Aug 22;8(1): Zoznam originálnych prác použitých v ŠPP OLG/17: 1. MRC-Holland MLPA General Protocol, 2. Ticha I., Kleibl Z., Stribrna J. a kol.: Screening for genomic rearragements in a genes in Czech high-risk breast/ovarian cancer patients: high proportion of population specific alterations in gene. Breast Cancer Research and Treatment. 2010, 124 (2): Sluiter MD., van Rensburg EJ.: Large genomic rearragements of the BRCA1 and BRCA2 genes: review of the literature and report of a novel BRCA1 mutation. Breast Cancer Research and Treatment, 2011, 125: Osoby spôsobilé modifikovať a validovať metódy na Oddelení lekárskej genetiky: Meno a priezvisko, tituly Spôsobilosť modifikovať a validovať metódy číslo položky v rozsahu akreditácie Regína Lohajová Behulová, RNDr., PhD. 1.1 až 6.1 Katarína Závodná, RNDr., PhD. 1.1 až 6.1 Ľudmila Vavrová, Ing., PhD. 1.1 až 6.1 Tomáš Slamka, Mgr. 1.1 až 6.1 Lukáš Šebest, Mgr., PhD. 1.1 až 6.1 Aster Alemayehu, RNDr., PhD. 1.1 až 6.1

13 13 z 13 Použité skratky: AGLUT aglutinačná reakcia AOD askorbátoxidáza BRCA označenie génu asociovaného s dedičnou formou mamárneho/ovariálneho karcinómu CDKN2A označenie génu asociovaného s dedičnou formou malígneho melanómu E6/E7 - HPV vírusové onkogény asociované so vznikom a progresiou Ca krčka maternice FOTO - fotometria GLD glutamátdehydrogenáza GPO glycerol-3-fosfát-oxidáza HPLC High Performance Liquid Chromatography HPV human papillomavirus (ľudský papilloma vírus) CHOD cholesteroloxidáza IFCC International Federation for Clinical Chemistry IMF meranie fluorescencie po značení buniek protilátkami KOAG Coagulation Point Detection Method KRAS označenie génu, kt. somatické mutácie v sú predikatívnym markerom pri metastazujúcom ca hrubého čreva LATEX Latex immunoassay method MLH1 - označenie génu asociovaného s dedičnou formou kolorektálneho karcinómu MSH2 - označenie génu asociovaného s dedičnou formou kolorektálneho karcinómu NRAS označenie génu, kt. somatické mutácie v sú predikatívnym markerom pri metastazujúcom ca hrubého čreva OHT - Oddelenie hematológie a transfuziológie OID Oddelenie imunodiagnostiky OKB Oddelenie klinickej biochémie OKIA - Oddelenie klinickej imunológie a alergológie OKPC - Oddelenie klinickej patológie a cytológie OLG Oddelenie lekárskej genetiky PAP peroxidáza polymerázová reťazová reakcia PHOTO spektrofotometrická metóda PLP pyridoxalfosfát POD peroxidáza RET označenie génu v dedičnej forme medulárneho karcinómu a syndrómu mnohopočetnej endokrinnej neoplázie typu 2 RIA - Radio Immunoassay RT - Real-Time ŠPP Štandardný pracovný postup TPO Tyreoidálna peroxidáza TRACE Time Resolved Amplified Cryptate Emission ***