NRC pre pneumokokové nákazy

NRC pre pneumokokové nákazy

1. NRC pre pneumokokové nákazy bolo zriadené Ministerstvom zdravotníctva SR rozhodnutím č. Z61839/2010-OZS dňom 01.01.20110T.0T 2. Personálne obsadenie lekári 2 doc. MUDr. Cyril Klement, CSc., vedúci NRC MUDr. Mária Avdičová, PhD. počet iných odborných pracovníkov s VŠ vzdelaním III. stupňa: 1 RNDr. Lucia Maďarová, PhD. počet iných odborných pracovníkov s VŠ vzdelaním II. stupňa: 1 RNDr. Edita Bottková počet pracovníkov s ÚSOV (laboranti): 1 Renáta Hricová 3. Akreditácia - podľa predpisu (STN EN ISO/IEC 17 025:2005) akreditovaná metodika na diagnostiku bakteriálnych agens pomocou PCR - od 2011 platnosť do 2015 4. Činnosť NRC (pracoviska) 4.1. Odborná činnosť 4.1.1 UŤažiskové úlohy laboratórna diagnostika Streptococcus pneumoniae z biologického materiálu kultivačnými metódami, metódami priameho dôkazu nukleovej kyseliny (PCR), sérotypizácia kmeňov izolovaných najmä z invazívnych ochorení vykonávanie nadstavbovej diagnostiky pre ostatné laboratóriá spolupráca s ECDC (Európske stredisko na prevenciu a boj s nákazlivými ochoreniami) vedenie databázy epidemiologických a laboratórnych údajov v spolupráci s NRC pre sledovanie antibiotickej rezistencie (ÚVZ SR) sledovanie ATB rezistencií u kmeňov izolovaných z invazívnych ochorení uchovávanie kmeňov S. pneumoniae izolovaných z invazívnych ochorení, zbierka kmeňov odborná a metodická činnosť konzultácie zavádzanie nových diagnostických metód implementácia odporúčaní ECDC do laboratórnej diagnostickej praxe V roku 2014 bolo do NRC doručených spolu 79 kmeňov resp. pôvodných biologických materiálov S. pneumoniae. Všetky viabilné kmene S. pneumoniae boli zaradené do zbierky NRC. Zastúpenie sérotypov ako aj pôvodných biologických materiálov sumarizujú tabuľky č. 1 a 2. V dvoch prípadoch nebolo možné určiť sérotyp. Všetky informácie týkajúce sa kmeňov izolovaných z pôvodne sterilných tekutín, zaslané do NRC na sérotypizáciu a ďalšiu analýzu sú zároveň prístupné po kontaktovaní pracovníkov NRC (www.vzbb.sk).

Tab. č. 1: Prehľad počtu jednotlivých sérotypov kmeňov S. pneumoniae a pôvodných biologických materiálov zaslaných do NRC pre pneumokokové nákazy, z ktorých boli zistené sérotypy izolované, rok 2014. Sérotyp Počet izolovaných kmeňov 1 1 3 10 4 5 6A 2 6B 1 6C 2 7F 4 8 3 9V 1 9N 2 11A 2 12A/12B/12C/44/46 1 14 2 15A 5 15B 1 15B/C 1 15C 1 17F 1 18A 1 18C 1 19A 13 19F 3 22F 1 23A 1 23B 1 23A/B 1 24F 1 25/38/43/45/48 1 29/34/42 1 31 1 33F/33A 1 35B 4 36 1 Neurčený sérotyp 2

Tab. č. 2: Počet a typ pôvodných materiálov, z ktorých boli pneumokokové kmene izolované. Materiál Počet Hemokultúra 41 Likvor 21 Likvor + hemokultúra 2 Hemokultúra + absces 1 Hemokultúra + hrudný punktát 1 Hemokultúra + hrudný výpotok 1 Hemokultúra + ster z mozgových blán 1 Likvor + endotracheálna kanyla 1 Abdominálny punktát 1 Ster z dutiny brušnej 1 Hnis z brucha 2 Punktát z kolena 2 Absces v mozgu 1 Hrudný punktát 2 Pleurálny punktát 1 Všeobecný výskyt pneumokokových invazívnych ochorení podľa vekovošpecifickej chorobnosti a trend výskytu pneumokokových ochorení za posledných 20 rokov je zdokumentovaný na obrázkoch 1-2. Podrobný rozpis invazívnych pneumokokových ochorení, spadajúcich pod diagnózy A40.3 - septikémia a G00.1 meningitída a J13 pneumónia spôsobená S. pneumoniae, je uvedený v tabuľkách č. 3-8 a na obrázkoch 3-5. Mapy výskytu podľa jednotlivých diagnóz (A40.3, G00.1 a J13) sú znázornené na obr. 6-8. Všetky epidemiologické výstupy z EPIS sú aktuálne ku dňu 23.01.2014. 4.1.2 UNovozavedené metódyu V súvislosti so zavedením plošnej vakcinácie proti pneumokokom sa do diagnostiky validovala a optimalizovala metóda pulznej elektroforézy (PFGE). Analýza pomocou PFGE umožňuje triedenie jednotlivých kmeňov do skupín a porovnáva sa ich genetická príbuznosť resp. odlišnosť. V NRC pre pneumokokové nákazy sa vykonáva sérotypizácia pomocou Quellungovej reakcie a pomocou latexovej aglutinácie. Tieto dve metódy boli rozšírené o ďalšiu sérotypizačnú metódu založenú na princípoch molekulárnej biológie a síce Multiplex PCR. Nespornou výhodou multiplex PCR je možnosť stanovenia sérotypu aj z kultivačne negatívnych pôvodných biologických materiálov ako aj z neviabilných kmeňov S. pneumoniae. 4.1.3 UMedzilaboratórne porovnania V roku 2014 sa v dňoch 24.1.-7.2. 2014 NRC pre pneumokokové nákazy zúčastnilo medzilaboratórneho porovnania s Národní referenční laboratoří pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Prahe. Celkovo boli vyhodnocované 4 vzorky kmeňov S. pneumoniae neznámych sérotypov. Vo všetkých 4 ukazovateľoch NRC obstálo na 100%. V roku 2014 NRC vykonalo externú kontrolu kvality formou medzilaboratórneho porovnania pre NRL pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Prahe. Spolu boli do Prahy zaslané 4 kmene S. pneumoniae. U všetkých 4 kmeňov bol NRL v Prahe stanovený zhodný sérotyp ako v NRC pre pneumokokové nákazy RÚVZ BB.

Iná 4.1.4 U odborná činnosť NRC sa zapojilo do Programov a projektov, ktorých vyhlasovateľom je Hlavný hygienik Slovenskej republiky. Projekt: Surveillance invazívnych pneumokokových ochorení. Cieľom projektu je monitorovanie zastúpenia sérotypov kmeňov S. pneumoniae, ktoré sú pôvodcami invazívnych pneumokokových ochorení (IPO) ako aj skvalitnenie surveillance IPO na Slovensku. Dňa 12.09.2014 navštívil RÚVZ BB riaditeľ ECDC Dr. Mark Sprenger, v rámci návštevy bol formou prednášok oboznámený s činnosťami RÚVZ a NRC zriadených na RÚVZ BB medzi nimi aj NRC pre pneumokokové nákazy. Po oboznámení sa s činnosťou NRC riaditeľ ECDC navštívil laboratóriá NRC pre pneumokokové nákazy. 5. Legislatívna činnosť NRC sa podieľalo na plnení Odborného usmernenia na zabezpečenie surveillance pneumokokových invazívnych ochorení v Slovenskej republike, ktoré vyšlo vo vestníku MZ SR z dňa 01. septembra 2011. 6. Metodická, konzultačná a výuková činnosť NRC aktívne spolupracovalo a metodicky usmerňovalo lekárov a pracoviská klinických mikrobiológií NRC usmerňovalo epidemiológov a klinických mikrobiológov pri odbere a transporte materiálu, určeného na bližšiu identifikáciu pomocou molekulárno-biologických metód a sérotypizácie NRC vypracovalo metodický pokyn, ktorý bol zaslaný formou listu na oddelenia epidemiológií príslušných RÚVZ a na oddelenia klinických mikrobiológií, týkajúci sa zasielania pôvodných klinických materiálov a kmeňov S. pneumoniae izolovaných z primárne sterilných tekutín iných ako likvor a hemokultúra (napr. punktáty) NRC poskytovalo priebežne konzultácie najmä lekárom a pracovníkom klinických mikrobiológií a oddelení epidemiológie NRC vypracovalo metódu zasielania kmeňov určených na sérotypizáciu, ktorá zefektívňuje celý proces výsledky a nové poznatky ako aj odporúčania týkajúce sa diagnostiky a surveillance invazívnych pneumokokových ochorení boli prezentované na zahraničných a domácich podujatiach (viď publikačná a prednášková činnosť) ako aj na webovej stránke RÚVZ BB NRC sa podieľalo na zorganizovaní I. Konzultačného dňa NRC zriadených na RÚVZ BB (KD) a v rámci KD boli prezentované prednášky na tému epidemiologickej situácie, a diagnostiky Streptococcus pneumoniae (viď publikačná a prednášková činnosť) 7. Členstvo a zastupovanie v pracovných skupinách a výboroch, v odborných spoločnostiach, technických a skúšobných komisiách. doc. MUDr. Cyril Klement, CSc. National Focal Point for Microbiology, ECDC

P Pneumo P Pneumo 8. Účasť na zahraničných pracovných cestách a odborných podujatiach V roku 2014 sa URNDr. Lucia Maďarová, PhD. a RNDr. Edita BottkováU zúčastnili na zahraničnej konferencii s medzinárodnou účasťou: The 7th Pneumo Surveillance Summit, Turecko, Istanbul, aktívna účasť, prednáška a poster, 25.09.2014-27.09.2014 (viď prednášková a publikačná činnosť) V dňoch 1.12.2014-2.12.2014 sa URNDr. Edita BottkováU zúčastnila Workshopu zameraného na genotypizáciu a sekvenáciu kmeňov S. pneumoniae, Nemecko, Frankfurt Udoc. MUDr. Cyril Klement, CSc. Meeting of Experts,August 2014, Švajčiarsko, Ženeva Meeting of States Parties, December 2014 9. Publikačná a prednášková činnosť rok 2014 1. BOTTKOVÁ E., KLEMENT C., MAĎAROVÁ L., ČAMAJOVÁ J., AVDIČOVÁ M., HUPKOVÁ H., HUDEČKOVÁ H.P PTRENDY VO VÝSKYTE INVAZÍVNYCH SÉROTYPOV STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE NA SLOVENSKU. V. SLOVENSKÝ VAKCINOLOGICKÝ KONGRES, 16.-18. január 2014, Hotel PATRIA, Štrbské Pleso, aktívna účasť prednáška. 2. BOTTKOVÁ E., KLEMENT C., MAĎAROVÁ L., ČAMAJOVÁ J. Využitie molekulárnobiologických metód v NRC pre pneumokokové nákazy. XI. ODBORNÁ KONFERENCIA NRC 18.3.2014, aktívna účasť prednáška. 3. ČAMAJOVÁ, J. National Reference Centre for pneumococcal diseases. Návšteva riaditeľa ECDC Marka Sprengera, MD., 12.09.2014, RÚVZ BB. 4. MAĎAROVÁ, L., BOTTKOVÁ, E., ČAMAJOVÁ, J., KLEMENT, C., AVDIČOVÁ, M. National Reference Centre for Pneumococcal Diseases Slovakia, Update on the country-specific th surveillance program, 7P Surveillance Summit, Istanbul, Turecko, 25.09.2014-27.09.2014.Istanbul. 5. ČAMAJOVÁ, J., MAĎAROVÁ, L., KLEMENT, C., BOTTKOVÁ, E., AVDIČOVÁ, M., HUDEČKOVÁ, H. Surveillance of Invasive Pneumococcal Diseases in the Slovak Republic, th 2011 2013, 7P Surveillance Summit, Istanbul, Turecko, 25.09.2014-27.09.2014.Istanbul. 6. AVDIČOVÁ M., KLEMENT C., BOTTKOVÁ E., MAĎAROVÁ L., ČAMAJOVÁ J. Surveillance pneumokokových invazívnych nákaz v SR v r. 2011-2013 VII. Kongres SSKM SLS Nový Smokovec hotel Atrium 24. 26. októbra 2014 7. AVDIČOVÁ, M., KLEMENT, C., MAĎAROVÁ, L., BOTTKOVÁ, E., ČAMAJOVÁ, J. Invazívne pneumokokové ochorenia včera a dnes. I. Konzultačný deň NRC na RÚVZ BB, 26.11.2014, RÚVZ BB 8. BOTTKOVÁ, E., KLEMENT., C., MAĎAROVÁ, L., ČAMAJOVÁ, J., AVDIČOVÁ, M., HUDEČKOVÁ, H. Diagnostika Streptococcus pneumoniae v podmienkach NRC. I. Konzultačný deň NRC na RÚVZ BB, 26.11.2014, RÚVZ BB 9. KRÁLINSKÝ, K., TAKÁČ, B., KLEMENT, C., MAĎAROVÁ, L., KRIŠTÚFKOVÁ, Z. Závažná pneumokoková pneumónia kazuistiky. 2014. Pediatria, Suplement, roč.9, s. 8-11. 10. BOTTKOVÁ, E., KLEMENT, C., MAĎAROVÁ, L., ČAMAJOVÁ, J., AVDIČOVÁ, M., HUPKOVÁ, H., HUDEČKOVÁ, H. Sérotypy invazívnych pneumokokových infekcií v rokoch 2011-2013 na Slovensku. 2014. Pediatria, Suplement, roč.9, s. 14-17.

Obr. 1: Vekovošpecifická chorobnosť, pneumokokové infekcie, rok 2014. Spolu všetky diagnózy. Obr. 2: Trend výskytu pneumokokových ochorení za posledných 20 rokov.

Tab. 3: Výskyt septikémie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (A 40.3), podľa krajov, 2014 Nahlasené za obdobie: 2014 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR A40.3 a 2 3 7 3 3 7 7 3 35 r 0,32 0,54 1,18 0,44 0,43 1,07 0,85 0,38 0,65 Tab. 4: Výskyt septikémie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (A 40.3) v roku 2014, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2014 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu A40.3 a 2 0 1 1 0 0 1 8 5 7 10 35 r 3,63 0,00 0,36 0,38 0,00 0,00 0,12 0,95 0,69 0,95 1,36 0,65 Obr. 3: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (septikémie A40.3) v roku 2014.

Tab. 5: Výskyt meningitídy vyvolanej Streptococcus pneumoniae (G00.1), podľa krajov, 2014 Nahlásené za obdobie: 2014 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR G00.1 a 4 3 2 4 1 5 4 2 25 r 0,65 0,54 0,34 0,58 0,14 0,76 0,49 0,25 0,46 Tab. 6: Výskyt meningitídy vyvolanej Streptococcus pneumoniae (G00.1) v roku 2014, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2014 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu G00.1 a 0 0 0 0 1 0 5 2 3 9 5 25 r 0,00 0,00 0,00 0,00 0,33 0,00 0,58 0,24 0,41 1,23 0,68 0,46 Obr. 4: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (pneumokoková meningitída G00.1) v roku 2014.

Tab. 7: Výskyt pneumónie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (J13), podľa krajov, 2014 Nahlásené za obdobie: 2014 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR J13 a 5 1 0 0 0 3 4 3 16 r 0,81 0,18 0,00 0,00 0,00 0,46 0,49 0,38 0,3 Tab. 8: Výskyt pneumónie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (J13) v roku 2014, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2014 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu J13 a 2 1 0 1 1 0 1 0 2 2 6 16 r 3,63 0,42 0,00 0,38 0,33 0,00 0,12 0,00 0,27 0,27 0,82 0,3 Obr. 5: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (pneumokoková pneumónia J13) v roku 2014.

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2014, Diagnóza 'A403' <0,00-2,02) <2,02-4,04) <4,04-6,06) <6,06-8,08) <8,08-10,10) <10,10-12,11> Obr. 6 Výskyt pneumokokovej sepsy na Slovensku v roku 2014 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2014, Diagnóza 'G001' <0,00-0,93) <0,93-1,85) <1,85-2,78) <2,78-3,70) <3,70-4,63) <4,63-5,55> Obr. 7: Výskyt pneumokokovej meningitídy na Slovensku v roku 2014 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2014, Diagnóza 'J13' <0,00-0,81) <0,81-1,61) <1,61-2,42) <2,42-3,22) <3,22-4,03) <4,03-4,83> Obr. 8: Výskyt pneumokokmi vyvolanej pneumónie na Slovensku v roku 2014 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR