NRC pre pneumokokové nákazy

NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy

1. NRC pre pneumokokové nákazy bolo zriadené Ministerstvom zdravotníctva SR rozhodnutím č. Z61839/2010-OZS dňom 01.01.20110T.0T 2. Personálne obsadenie lekári 2 prof. MUDr. Cyril Klement, CSc., vedúci NRC doc. Mária Avdičová, PhD. počet iných odborných pracovníkov s VŠ vzdelaním III. stupňa: 1 RNDr. Lucia Maďarová, PhD. RNDr. Edita Bottková, PhD. počet pracovníkov s ÚSOV (laboranti): 1 Renáta Hricová 3. Akreditácia - podľa predpisu (STN EN ISO/IEC 17 025:2005) akreditovaná metodika na diagnostiku bakteriálnych agens pomocou PCR - od 2015 platnosť do 2020 4. Činnosť NRC (pracoviska) 4.1. Odborná činnosť 4.1.1 UŤažiskové úlohy laboratórna diagnostika Streptococcus pneumoniae z biologického materiálu kultivačnými metódami, metódami priameho dôkazu nukleovej kyseliny (PCR), sérotypizácia kmeňov izolovaných najmä z invazívnych ochorení v roku 2016 sa v súvislosti s rozšírením názvu NRC (NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy) a aj jeho pôsobnosti opätovne rozšírila aj diagnostika o dôkaz Haemophilus influenzae pomocou real-time PCR, konvenčnej PCR a sérotypizácie pomocou konvenčnej PCR vykonávanie nadstavbovej diagnostiky pre ostatné laboratóriá spolupráca s ECDC (Európske stredisko na prevenciu a boj s nákazlivými ochoreniami) vedenie databázy epidemiologických a laboratórnych údajov v spolupráci s NRC pre sledovanie antibiotickej rezistencie (ÚVZ SR) sledovanie ATB rezistencií u kmeňov izolovaných z invazívnych ochorení uchovávanie kmeňov S. pneumoniae a Haemophilus influenzae izolovaných z invazívnych ochorení, zbierka kmeňov odborná a metodická činnosť konzultácie zavádzanie nových diagnostických metód implementácia odporúčaní ECDC do laboratórnej diagnostickej praxe V roku 2015 bolo do NRC doručených spolu 78 kmeňov resp. pôvodných biologických materiálov S. pneumoniae. Všetky viabilné kmene S. pneumoniae boli zaradené do zbierky NRC. Zastúpenie sérotypov ako aj pôvodných biologických materiálov sumarizujú tabuľky č. 1 a 2. V troch prípadoch nebolo možné určiť sérotyp. Všetky informácie týkajúce sa kmeňov izolovaných z pôvodne sterilných tekutín, zaslané do NRC na sérotypizáciu a ďalšiu analýzu sú zároveň prístupné po kontaktovaní pracovníkov NRC (www.vzbb.sk). Na prítomnoť Haemophilus influenzae boli v roku 2015 vyšetrené tri biologické materiály (likvor). Prítomnosť H. influenzae sa nepotvrdila ani v jednom z prípadov.

Tab. č. 1: Prehľad počtu jednotlivých sérotypov kmeňov S. pneumoniae a pôvodných biologických materiálov zaslaných do NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy, z ktorých boli zistené sérotypy izolované, rok 2015. Sérotyp Počet izolovaných kmeňov 19A 14 3 10 15A 4 7F 3 8 3 6A 2 6B 2 10B 2 11A 2 18C 2 23A 2 23B 2 31 2 35F 2 1 1 4 1 6A/B 1 6C 1 7A 1 10A 1 14 1 15F/A 1 15B 1 15C 1 15B/C 1 16F 1 17F 1 Sg. 18 1 19F 1 20 1 22F/A 1 22F 1 23F 1 24F 1 25/38/43/45/48 1 33F/A 1 39 1 Neurčený sérotyp 3

Tab. 2: Počet a typ pôvodných materiálov, z ktorých boli pneumokokové kmene izolované. Materiál Počet Hemokultúra 44 Likvor 20 Pleurálny punktát 4 Výpotok brušná dutina 3 Ascites 1 Ster z mozgových blán 1 Ster z rany-mastoiditída 1 Punktát absces 1 Punktát kĺb 1 Plodová voda 1 Likvor+Hemokultúra 1 Všeobecný výskyt pneumokokových invazívnych ochorení podľa vekovošpecifickej chorobnosti a trend výskytu pneumokokových ochorení za posledných 20 rokov je zdokumentovaný na obrázkoch 1-2. Podrobný rozpis invazívnych pneumokokových ochorení, spadajúcich pod diagnózy A40.3 - septikémia a G00.1 meningitída a J13 pneumónia spôsobená S. pneumoniae, je uvedený v tabuľkách č. 3-10 a na obrázkoch 3-6. Mapy výskytu podľa jednotlivých diagnóz (A40.3, G00.1, J13 a A48.5) sú znázornené na obr. 7-9. Všetky epidemiologické výstupy z EPIS sú aktuálne ku dňu 26.01.2015. 4.1.2 UNovozavedené metódyu V súvislosti so zavedením plošnej vakcinácie proti pneumokokom sa do diagnostiky validovala a optimalizovala metóda pulznej elektroforézy (PFGE). Analýza pomocou PFGE umožňuje triedenie jednotlivých kmeňov do skupín a porovnáva sa ich genetická príbuznosť resp. odlišnosť. V NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy sa vykonáva sérotypizácia pomocou Quellungovej reakcie a pomocou latexovej aglutinácie. Tieto dve metódy boli rozšírené o ďalšiu sérotypizačnú metódu založenú na princípoch molekulárnej biológie a síce Multiplex PCR. Nespornou výhodou multiplex PCR je možnosť stanovenia sérotypu aj z kultivačne negatívnych pôvodných biologických materiálov ako aj z neviabilných kmeňov S. pneumoniae. Vzhľadom na stúpajúci počet atypických materiálov bola zavedená nová diagnóza pod číslom A 48.5 iné invazívne pneumokokové ochorenia. V roku 2015 bola do laboratórnej praxe zavedená a optimalizovaná metóda real-time PCR na dôkaz prítomnosti Haemophilus influenzae. 4.1.3 UMedzilaboratórne porovnania V roku 2015 sa v dňoch 23.06.2015-07.07.2015 NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy zúčastnilo medzilaboratórneho porovnania s Národní referenční laboratoří pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Prahe. Celkovo boli vyhodnocované 4 vzorky kmeňov S. pneumoniae neznámych sérotypov. Vo všetkých 4 ukazovateľoch NRC obstálo na 100%. V roku 2015 NRC vykonalo externú kontrolu kvality formou medzilaboratórneho porovnania pre NRL pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Prahe. Spolu

Iná boli do Prahy zaslané 4 kmene S. pneumoniae. U všetkých 4 kmeňov bol NRL v Prahe stanovený zhodný sérotyp ako v NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy RÚVZ BB. 4.1.4 U odborná činnosť NRC sa zapojilo do Programov a projektov, ktorých vyhlasovateľom je Hlavný hygienik Slovenskej republiky. Projekt: Surveillance invazívnych pneumokokových ochorení. Cieľom projektu je monitorovanie zastúpenia sérotypov kmeňov S. pneumoniae, ktoré sú pôvodcami invazívnych pneumokokových ochorení (IPO) ako aj skvalitnenie surveillance IPO na Slovensku. 5. Legislatívna činnosť NRC sa podieľalo na plnení Odborného usmernenia na zabezpečenie surveillance pneumokokových invazívnych ochorení v Slovenskej republike, ktoré vyšlo vo vestníku MZ SR z dňa 01. septembra 2011. Od 01.05.2015 sa zmenil názov NRC na NRC pre pneumokokové a hemofilové nákazy. V súvislosti s tým sa zmenila aj pôsobnosť NRC. 6. Metodická, konzultačná a výuková činnosť NRC aktívne spolupracovalo a metodicky usmerňovalo lekárov a pracoviská klinických mikrobiológií NRC usmerňovalo epidemiológov a klinických mikrobiológov pri odbere a transporte materiálu, určeného na bližšiu identifikáciu pomocou molekulárno-biologických metód a sérotypizácie NRC vypracovalo metodický pokyn, ktorý bol zaslaný formou listu na oddelenia epidemiológií príslušných RÚVZ a na oddelenia klinických mikrobiológií, týkajúci sa zasielania pôvodných klinických materiálov a kmeňov S. pneumoniae izolovaných z primárne sterilných tekutín iných ako likvor a hemokultúra (napr. punktáty) NRC poskytovalo priebežne konzultácie najmä lekárom a pracovníkom klinických mikrobiológií a oddelení epidemiológie NRC vypracovalo metódu zasielania kmeňov určených na sérotypizáciu, ktorá zefektívňuje celý proces výsledky a nové poznatky ako aj odporúčania týkajúce sa diagnostiky a surveillance invazívnych pneumokokových ochorení boli prezentované na zahraničných a domácich podujatiach (viď publikačná a prednášková činnosť) ako aj na webovej stránke RÚVZ BB 7. Členstvo a zastupovanie v pracovných skupinách a výboroch, v odborných spoločnostiach, technických a skúšobných komisiách. prof. MUDr. Cyril Klement, CSc. National Focal Point for Microbiology, ECDC 8. Účasť na zahraničných pracovných cestách a odborných podujatiach URNDr. Bottková, E.U sa zúčastnila IBD-Labnet Haemophilus influenzae Training Workshop, Respiratory and Vaccine Preventable Bacteria Reference Unit, Public Health England, Veľká Británia, Londýn, 10.-11.3.2015. URNDr. Lucia Maďarová, PhD. Uzúčastnila na zahraničnej konferencii s medzinárodnou účasťou: The 13th EMGM, Holandsko, Amsterdam, aktívna účasť, poster, 14.09.2015-17.09.2015 (viď prednášková a publikačná činnosť) Udoc. MUDr. Cyril Klement, CSc.:

Meeting of Experts,August 2015, Švajčiarsko, Ženeva Meeting of States Parties, December 2015,, Švajčiarsko, Ženeva 9. Publikačná a prednášková činnosť rok 2015 Prednášky 1. UBottková, E.,U Maďarová, L., Klement, C., Čamajová, J., Avdičová, M., Hudečková, H. Aktuálny stav vo výskyte invazívnych infekcií spôsobených Streptococcus pneumoniae na Slovensku, sérotypy a možnosti diagnostiky. VI. Vakcinologický kongres, hotel Patria, Štrbské pleso, 15-17.01.2015, prednáška. 2. Bottková, E., UMaďarová, L.,U Klement, C., Avdičová, M., Hudečková, H. Výskyt invazívnych infekcií spôsobených Streptococcus pneumoniae na Slovensku v období rokov 2011-2014. XII. Vedecko-odborná konferencia Národných referenčných centier pre surveillance infekčných chorôb v SR, prednáška. 3. UBottková E.U, Maďarová L., Klement C., Avdičová M., Hudečková H. Invazívne pneumokokové infekcie na Slovensku a v Európe. XX. Červenkove dni preventívnej medicíny, 27.04.2015-29.04.2015, Hotel Stupka Tále. 4. UBottková, E., Maďarová, L., Avdičová, M.,U Klement, C., Hudečková, H. Invazívne infekcie spôsobené Streptococcus pneumoniae na Slovensku v období rokov 2011-2014. Mediforum, Škola očkovania. 10.04.2015, Hotel Best Western Polom, Žilina; 17.04.2015, Podbanské; 15.05.2015, Hotel Kaskády; 22.05.2015, hotel Double Tree by Hilton, Bratislava, prednášky. 5. Bottková, E., UMaďarová, L.,U Avdičová, M., Klement, C., Hudečková, H. Invazívne infekcie spôsobené Streptococcus pneumoniae na Slovensku v období rokov 2011-2014. XI. Slovenského pediatrický kongres s medzinárodnou účasťou Košice, 04.06.2015-06.06.2015, hotel Double Tree by Hilton. Prednáška. 6. Diskusné sústredenie v epidemiológii infekčných chorôb. Škola vakcinológie. 09.06.2015, SZU BA, pasívna účasť. Bottková, E., Maďarová, L. 7. UMaďarová, L.U, Bottková, E., Klement, C. Súčasná epidemiologická situácia invazívnych a neinvazívnych pneumokokových ochorení na Slovensku. Pfizer stretnutie poisťovní. 22.09.2015, Bratislava, prednáška. 8. UMaďarová, L.,U Bottková, E., Králinský, K., Klement, C., Avdičová, M., Hudečková, H. NATIONAL SURVEILLANCE SYSTEM OF IPD IN SLOVAKIA, 2011-2014. Poster, 13th EMGM congress, Amsterdam, Holandsko Publikácie: 1. Bottková, E., Maďarová, L., Klement, C., Čamajová, J., Avdičová, M., Hudečková, H. Aktuálny stav vo výskyte invazívnych infekcií spôsobených Streptococcus pneumoniae na Slovensku, sérotypy a možnosti diagnostiky. Zborník abstraktov z prednášok VI. Vakcinologický kongres. ISBN 978-80-971836-3-9. 2. K. Králinský, L. Maďarová, E. Bottková, B. Takáč, S. Dluholucký, C. Klement. Prevencia proti pneumokokovým ochoreniam na Slovensku. Zdravotnicke noviny, rocnik XX/LXIV, 11. jun 2015, c. 23, str. 3 3. Bottková E. Kompendium medicíny. Výskyt pneumokokových ochorení 2011-2014. Mediforum škola očkovania. Jún 2015, str. 8-9.

Obr. 1: Vekovošpecifická chorobnosť, pneumokokové infekcie, rok 2015. Spolu všetky diagnózy. Obr. 2: Trend výskytu pneumokokových ochorení za posledných 20 rokov.

Tab. 3: Výskyt septikémie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (A 40.3), podľa krajov, 2015 Nahlasené za obdobie: 2015 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR A40.3 a 10 0 1 4 8 3 4 5 35 r 1,60 0,00 0,17 0,58 1,16 0,46 0,49 0,63 0,65 Tab. 4: Výskyt septikémie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (A 40.3) v roku 2015, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2015 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu A40.3 a 2 1 0 0 0 0 0 2 4 14 12 35 r 3,60 0,43 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,23 0,55 1,9 1,59 0,65 Obr. 3: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (septikémie A40.3) v roku 2015.

Tab. 5: Výskyt meningitídy vyvolanej Streptococcus pneumoniae (G00.1), podľa krajov, 2015 Nahlásené za obdobie: 2015 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR G00.1 a 2 1 1 5 1 1 4 6 21 r 0,32 0,18 0,17 0,73 0,14 0,15 0,49 0,75 0,39 Tab. 6: Výskyt meningitídy vyvolanej Streptococcus pneumoniae (G00.1) v roku 2015, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2015 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu G00.1 a 0 1 1 1 0 1 1 2 5 4 5 21 r 0,00 0,43 0,36 0,38 0,00 0,27 0,12 0,23 0,69 0,54 0,66 0,39 Obr. 4: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (pneumokoková meningitída G00.1) v roku 2015.

Tab. 7: Výskyt pneumónie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (J13), podľa krajov, 2015 Nahlásené za obdobie: 2015 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR J13 a 3 0 0 0 1 2 3 4 13 r 0,48 0,00 0,00 0,00 0,14 0,31 0,37 0,50 0,24 Tab. 8: Výskyt pneumónie vyvolanej Streptococcus pneumoniae (J13) v roku 2015, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2015 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu J13 a 1 2 0 0 1 0 1 0 1 3 4 13 r 1,80 0,86 0,00 0,00 0,34 0,00 0,12 0,00 0,14 0,41 0,53 0,24 Obr. 5: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti (pneumokoková pneumónia J13) v roku 2015.

Tab. 9: Výskyt iných invazívnych ochorení spôsobených Streptococcus pneumoniae (A48.5), podľa krajov, 2015 Nahlásené za obdobie: 2015 Diagnoza/Kraj BL TA TC NI ZI BC PV KI SR A48.5 a 1 0 1 0 0 0 0 0 2 r 0,16 0,00 0,17 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,04 Tab. 10: Výskyt iných invazívnych ochorení spôsobených Streptococcus pneumoniae (A48.5) v roku 2015, rozdelenie podľa vekových skupín Nahlásené za období: 2015 Pohlavie: spolu Diagnóza/Veková skupina 0 01-04 5-9 10-14 15-19 20-24 25-34 35-44 45-54 55-64 65+ Spolu A48.5 a 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2 r 0,00 0,43 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,14 0,00 0,04 Obr. 6: Grafické znázornenie vekovo-špecifickej chorobnosti iných invazívnych ochorení spôsobených Streptococcus pneumoniae (A48.5) v roku 2015.

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2015, Diagnóza 'A403' Obr. 7 Výskyt pneumokokovej sepsy na Slovensku v roku 2015 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR <0,00-1,09) <1,09-2,17) <2,17-3,26) <3,26-4,35) <4,35-5,43) <5,43-6,52>

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2015, Diagnóza 'G001' <0,00-1,01) <1,01-2,02) <2,02-3,03) <3,03-4,04) <4,04-5,05) <5,05-6,06> Obr. 8: Výskyt pneumokokovej meningitídy na Slovensku v roku 2015 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2015, Diagnóza 'J13' <0,00-0,53) <0,53-1,06) <1,06-1,59) <1,59-2,12) <2,12-2,65) <2,65-3,17> Obr. 9: Výskyt pneumokokmi vyvolanej pneumónie na Slovensku v roku 2015 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR

Výskyt zvolenej diagnózy v SR podľa okresov miesta bydliska, v r. 2015, Diagnóza 'A48.5' iné invazívne pneumokokové ochorenia <0,00-0,36) <0,36-0,72) <0,72-1,08) <1,08-1,43) <1,43-1,79) <1,79-2,15> Obr. 9: Výskyt iných invazívnych pneumokokových ochorení na Slovensku v roku 2015 podľa okresov miesta bydliska. Zdroj údajov: EPIS, ÚVZ SR